BigWig to format pliku do wyświetlania gęstych, ciągłych danych w ścieżce przeglądarki genomu, utworzony przez konwersję z formatu Wiggle (WIG). Format BigWig jest opisany na stronie internetowej UCSC Genome Bioinformatics, a przewodnik po formatach plików Broad Institute zawiera dodatkowe informacje.
Co to jest format BigWig?
Format bigWig jest do wyświetlania gęstych, ciągłych danych, które będą wyświetlane jako wykres Pliki BigWig są tworzone początkowo z plików typu WIG, przy użyciu programu UCSC wigToBigWig. Alternatywnie, pliki bigWig można tworzyć z plików bedGraph, używając programu UCSC bedGraphToBigWig.
Jak używać pliku bigWig?
Przenieś nowo utworzony plik BigWig (myBigWig.bw) do dostępnej w Internecie lokalizacji http, https lub ftp. Wklej adres URL do formularza wpisu toru niestandardowego lub stwórz niestandardową ścieżkę za pomocą pojedynczej linii toru. Wklej niestandardową linię toru w polu tekstowym na stronie zarządzania torem niestandardowym.
Co to jest utwór BigWig?
bigWig Tracks to ścieżki dla ciągłych sygnałów w całym genomie. Nadają się do wyświetlania różnych „surowych” wyników eksperymentów, takich jak sygnały ChIP-Seq, sygnały RNA-Seq itp.
Jak utworzyć plik bigWig?
Istnieje wiele sposobów generowania plików Bigwig. Zwykle wiąże się to z konwersją. bam na ścieżkę wiggle (.wig), a następnie przekonwertowanie ścieżki wiggle w binarną ścieżkę bigwig (.
