Logo pl.boatexistence.com

Jak przebiega metagenomika?

Spisu treści:

Jak przebiega metagenomika?
Jak przebiega metagenomika?

Wideo: Jak przebiega metagenomika?

Wideo: Jak przebiega metagenomika?
Wideo: АНОДИРОВАНИЕ АЛЮМИНИЯ - Во все тяжкие 2024, Może
Anonim

Metagenomika jest zdefiniowana jako bezpośrednia analiza genetyczna genomów zawartych w próbce środowiskowej Dziedzina początkowo rozpoczęła się od klonowania środowiskowego DNA, po którym nastąpiło badanie przesiewowe ekspresji funkcjonalnej [1], a następnie szybko uzupełniono o bezpośrednie losowe sekwencjonowanie DNA środowiskowego metodą shotgun [2, 3].

Jak wygląda proces metagenomiki?

Metagenomika obejmuje pozyskiwanie DNA ze wszystkich mikroorganizmów w obrębie społeczności, bez konieczności identyfikowania wszystkich zaangażowanych gatunków. Po zsekwencjonowaniu genów i porównaniu ze zidentyfikowanymi sekwencjami można określić funkcje tych genów.

Jaka technika jest używana w metagenomice?

Próbka społeczności drobnoustrojów jest pobierana z wody morskiej, osadów, zwierząt gospodarza lub innego siedliska morskiego. Zebrane komórki są następnie poddawane lizie i DNA jest ekstrahowane z ich lizatu. Technika, która umożliwia metagenomikę, to sekwencjonowanie strzelbowe, które sekwencjonuje losowe regiony DNA w sposób nieukierunkowany.

Jakie są 3 kroki do badania metagenomiki?

Kroki i proces metagenomiki:

  1. Zbiór próbek:
  2. Ekstrakcja DNA:
  3. Przygotowanie próbki:
  4. Analiza próbki:

Jak wykonywana jest metagenomika funkcjonalna?

Funkcjonalna metagenomika obejmuje izolowanie DNA ze społeczności drobnoustrojów w celu zbadania funkcji zakodowanych białek. Obejmuje klonowanie fragmentów DNA, ekspresję genów w zastępczym gospodarzu i badanie przesiewowe pod kątem aktywności enzymatycznej.

Zalecana: