Trypsyna rozszczepia wiązanie peptydowe między grupą karboksylową argininy lub grupą karboksylową lizyny i grupą aminową sąsiedniego aminokwasu. Szybkość cięcia zachodzi wolniej, gdy reszty lizyny i argininy sąsiadują z aminokwasami kwasowymi w sekwencji lub cystyną.
Gdzie trypsyna rozszczepia aminokwasy?
Trypsyna rozszczepia peptydy na C-końcowej stronie reszt aminokwasowych lizyny i argininy. Jeśli reszta proliny znajduje się po stronie karboksylowej miejsca cięcia, cięcie nie nastąpi.
Jaką sekwencję odcina trypsyna?
Trypsyna rozszczepia wyłącznie C-terminal do pozostałości argininy i lizyny Prawie wszystkie projekty na dużą skalę w proteomice opartej na spektrometrii mas wykorzystują trypsynę do przekształcania mieszanin białek w łatwiejszy do analizy peptyd populacje.
Jakie aminokwasy ograniczają trypsyna i chymotrypsyna?
Trypsyna tnie na lizynę i argininę, podczas gdy chymotrypsyna. tnie tyrozynę, fenyloalaninę i tryptofan. Skąd enzym wie, że ma tam ciąć? Zaproponuj alternatywę dla asparaginianu i histydyny w triadzie katalitycznej.
Jakie aminokwasy rozszczepia pepsyna?
Pepsyna rozszczepia wiązania peptydowe po stronie aminowej cyklicznych reszt aminokwasowych ( tyrozyna, fenyloalanina i tryptofan), rozbijając łańcuchy polipeptydowe na mniejsze peptydy (Fange i Gaj, 1979).